Картезий, в соответствии со своими научными принципами, предлагает ряд Доказательств Бытия Бога: 1) мы можем его мыслить, так как Бог есть идея врождённая, но не приобретённая; 2) идея Бога, не может быть сотворённой, так как тогда человек был бы совершенным как творец идеи, но наличие сомнений, стремления к счастью свидетельствует о неудовлетворённости человека и, следовательно, его не совершенства; 3) существование это неотъемлемая часть бытия, и, следовательно, невозможно признать идею бытия Бога, не допуская его существования.

Говоря о законах управляющих нашим миром, Декарт прибегает к объяснению Мироздания Как Гигантского Механизма. По его мнению, механизмом является всё в этом мире. Цветы, растения, животные, человек подобны часам, шестерёнки которых созданы Богом, и превосходят по своей сложности и искусности любое самое прекрасное творение человека. Поэтому наука о природе это механика, а познание является процессом конструирования определённого варианта машины мира из простейших начал, которые уже содержаться в человеческом разуме.

Основными правилами познавательного метода, «познавательного конструирования» являются следующие правила: 1) следует начинать с простого и ОчевидногО, ясного и отчетливого, получаемого при помощи интуиции и лишённого сомнения (при этом не допустимо принимать что-либо на веру); 2) разделять сложное на простые части и, таким образом, избавляться от двусмысленности и получая очевидные данные; 3) синтезировать простые элементы путём дедукции в сложные целостные конструкции с воссозданием всех основных Взаимосвязей и взаимодействий; 4) контроль за тем, чтобы ни одно звено не было пропущено; 5) критерием истины следует считать интуицию, с помощью которой усматриваются первые начала.

Образцом для метода исследования Декарта стала математика. В определении «природы» он использовал математические понятия: фигура, протяжение, движение и т. п. А в качестве «всеобщей математики» называл алгебру. Всякое движение было сведено к пространственному перемещению, причиной которого являлся механический толчок, так как Декарт устранил понятие силы, цели.